[Image J] 簡易半定量分析

在跑完電泳時，常常會因為產物的亮度是否有差異而感到困擾

下文將介紹如何使用 Image J 這套生物影像分析軟體

進行簡易的半定量

首先如果你沒有 Image J 可以透以下網址進行下載:
https://drive.google.com/file/d/0B3X0hBEkbCjld1FtYktxZlAtQkE/edit?usp=sharing


1. 安裝後打開 Image J 和欲分析的影像




2. 接著由於 Image J 中默認白色區為訊號 (意即越白訊號越強)

    因此如果你的 data 是 "白底黑 band" 的話要先進行反轉 (Invert) 的動作

    使用  將整張圖圈起來或者使用 [Ctrl + A] 進行全選

    接著 [Edit > Invert] 或快速鍵 [Ctrl + Shift + I]




3. 然後便可開始進行半定量

    點選 圈選欲定量的band 進行以下定量動作

    按 [Ctrl + T] 或 [Edit > Selection > Add to Manager] 

    以滑鼠將圈選範圍移到到下一塊要定量的區域或者直接以游標圈選

    一樣進行以上動作進行定量

    重複上述動作 到你要定量的 band 做過一遍

4. 結束後，你會發現 旁邊默默地多出了一個 ROI Manager 的視窗


    那個就是你所圈選的目標，由上到下分別是你圈選的順序

    如果不小心圈錯了 你可以利用 ROI Manager 的 Delete 對錯誤的目標進行移除

    全部完成後 點選 ROI Manager 的 Measure

5. 最後就會跑出一個 Results 的視窗 其中 Mean 的欄位就是定量結果了


   全選後可以複製到 Excel 進行編輯





最後在整理一下重點：

1. 開啟 Image J 並打開要分析的 data

2. 全選 [Ctrl + A] 後，反轉訊號 [Ctrl + Shift + I] (核酸電泳可略過此步) 

3. 圈選欲分析的 band 按下 [Ctrl + T] 加到 ROI Manager 並把所有的 band 都加入

4. 按下 [Measure]

5. 將 Results 結果複製到 Excel 中進行分析


本文所介紹的是其中一種使用 Image J 的定量方式

Image J 還有其他較複雜的定量方法，提供分析不同的 data

有興趣的話 可以好好地摸索一番

Google大神也有很多這方面的教學

如果有其它的建議或不足的地方，歡迎留言討論



key word：電泳定量